En dos compendios de datos se unen los perfiles genéticos con
pruebas de drogas para crear la imagen más completa hasta ahora de cómo las
mutaciones pueden dar forma a un terapia al cáncer.
Los resultados, publicados en Nature ( http://www.nature.com ), sugieren que la eficacia de la mayoría de
los agentes anticancerígenos depende de la estructura genética del cáncer
contra el que se utilizan. Un estudio encontró una relación entre la
sensibilidad al fármaco y al menos una mutación en un gen relacionado con el
cáncer de 90% de los compuestos probados.
Cultivadas en laboratorio las células cancerosas son un
pilar de la investigación sobre la enfermedad. Los dos proyectos Catálogan las
características genéticas de cientos de dichas líneas celulares, incluyendo las
mutaciones en los genes asociados con el cáncer y los patrones de activación de
los genes. A continuación, estas características se hacen coincidir con la
forma en que las células responden a los medicamentos probados y en potencia.
"Este es un hallazgo muy poderoso", dice Tom
Hudson, presidente del Instituto de Investigación del Cáncer de Ontario en
Toronto, Canadá, que no estaba afiliado a la obra. "Se podría proporcionar
información valiosa para el diseño de ensayos clínicos, y conducir a enfoques
más específicos y menos costoso para el desarrollo de drogas".
Los tratamientos de cáncer diseñados cada vez más
específicamente para determinadas variantes genéticas de la enfermedad. Aun
así, las compañías farmacéuticas siguen luchando para averiguar qué pacientes
tienen más probabilidades de beneficiarse de un medicamento antes de los
ensayos clínicos, dice Levi Garraway, un investigador del cáncer en el
Instituto de Cáncer Dana-Farber en Boston, Massachusetts, y co-autor en el
estudio.
La respuesta de un cultivo de células de cáncer al tratamiento
depende de sus genes.
Con el objetivo de allanar el camino para el despliegue
racional de los medicamentos, Garraway y su equipo creo Cancer Cell que es una enciclopedia
en línea, un conjunto de información genómica para 947 líneas celulares, la
sensibilidad de drogas para 479 de esas líneas, y 24 agentes contra el cáncer.
Otro equipo, dirigido por Mathew Garnett del Instituto
Wellcome Trust Sanger en Hinxton, Reino Unido, ha creado un perfil similar con
639 líneas de células tumorales y 130 drogas.
Ambos equipos buscan a continuación a través de sus
recopilaciones, todo este a disposición del público en línea para que tengan
acceso a las asociaciones entre las características genéticas de las células y
su sensibilidad a los fármacos. Ambos grupos se concentran en posibles nuevas
vías para el tratamiento del sarcoma de Ewing, un cáncer de hueso que afecta
principalmente a niños y adultos jóvenes. El equipo de Sanger, por ejemplo,
encontró que algunas líneas celulares de sarcoma de Ewing son sensibles a los
medicamentos llamados inhibidores de la PARP.
Uno de los inhibidores de la PARP de prueba ya ha pasado por
varias rondas de ensayos clínicos para otros tipos de cáncer, y podría hacer
una transición rápida de la prueba contra el sarcoma de Ewing, dice Garnett.
Las enciclopedias serán de gran utilidad como herramienta de
investigación, dice John Weinstein, un biólogo computacional en el MD Anderson
Cancer Center en Houston, Texas.
Los resultados de los cultivos de células de cáncer no
siempre se traducen en la clínica. Las células cultivadas en placas no están
rodeados por otros tejidos del cuerpo, por ejemplo, a los fármacos se añaden a
las células en cultivo no tienen que circulan por el cuerpo antes de llegar a
su destino.
Pero la susceptibilidad de las células de ingeniería
genética y la evaluación de alto rendimiento por parte de las pantallas de
pruebas de miles de compuestos son valiosas herramientas de investigación.
Weinstein señala que, así como la generación de nuevos marcadores para
identificar a pacientes con más probabilidades de beneficiarse de un
tratamiento dado, las enciclopedias pueden ayudar a los investigadores para dar
seguimiento a las observaciones clínicas en el laboratorio.
"Si hay una respuesta concreta en la clínica, esto
podría ayudar a los investigadores mirar más incisiva en el mecanismo detrás de
esa respuesta", dice Weinstein. "Todo esto es parte de la tendencia
hacia la personalización de la terapia del cáncer."
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